本基金以結合社會資源持續改善本院硬體設備，提升醫療品質為宗旨。
本院計劃以14多公頃土地，希望為老人打造一個全台灣最好的老人社區，以重建老人健康生活型態為設計理念，結合醫療照護、居住安養、教育藝文、社會服務，提供從最健康的老人(生活完全能夠自理)，到二十四小時需要護理人員照顧的臥床老人，都能享有完整的服務與支持，讓入住的長者享有「有尊嚴」的獨立性生活空間與完全無障礙設施。本院計劃將居家、社區與機構式服務作有效的整合，期望發展出本土化的長期照護服務模式，以作為老人及身心障礙者專業人員的教育訓練與研發的最佳處所。
本基金依循門諾信則，持續從事山地暨社區醫療服務，以結合社會資源方式，加強社區醫療服務，讓所有需要者，皆能獲得整體之醫療照顧為宗旨。本院巡迴醫療隊每週前往之村落有北線的澳花、和平、和仁、和中，及南線的德武、觀音、福音、崙山等地。
本基金為落實本院「醫療與傳道」的宗旨，以支持院牧、傳道及院內各項醫療傳道事工之推展，並達成員工及病患之靈性關懷外，更希望在服事中領人歸主。
本基金以提供傑出醫師適當的教學研究經費，加強花東地區醫學研究及醫學教育的推展，使得本院整體醫療水準得以提升為宗旨。
本基金依循門諾信則，使貧病及弱勢者得以救助之信念，加強醫療及社會服務，雖然全民健保已普遍實施，但對於低收入戶及部分的原住民同胞而言，部分負擔仍造成家計的困難，此一基金的設立，能讓需要之患者、家屬，在整體的服務網絡下，得著完善的照護。
本基金依循門諾信則，結合社會資源方式，協助臨終病患獲得適當之醫療，解決病患之經濟困境，並促進各界對臨終病患的關懷為宗旨。
本基金依循門諾信則，使貧病及弱勢者得以救助之信念，以結合社會資源方式，協助長期照護之貧苦個案獲得良好照護環境，並促進各界對長期照護個案之關懷為宗旨。